Vid indirekt immunofluorescens undersökning snittas en vävnad eller celler och fixeras. Patientserum läggs på och de eventuella antikropparna reagerar med sitt antigen. De bundna antikropparna får reagera med fluorescensmärkt anti-human IgG antikropp. Man kan sedan i mikroskop se fluorescensen och där det finns fluorescens finns det antikroppar från patienten. Antikroppar mot olika antigen ger olika flourescerande mönster i cellerna.